Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd1P40201 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms