Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms