Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rfc1P35601 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms