Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms