Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Etv4P28322 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Etv4P28322 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms