Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afxP27661 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2afxP27661 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afxP27661 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afxP27661 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms