Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax3P24610 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax3P24610 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax3P24610 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms