Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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