Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfaP20033 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms