Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms