Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrphP15331 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrphP15331 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrphP15331 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrphP15331 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrphP15331 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrphP15331 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrphP15331 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrphP15331 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrphP15331 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrphP15331 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrphP15331 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrphP15331 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms