Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Calb1P12658 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms