Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt8P11679 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms