Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms