Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fv4P11370 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fv4P11370 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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