Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms