Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P10404 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P10404 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P10404 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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