Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb4P10284 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms