Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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TtrP07309 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtrP07309 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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