Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01668 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01668 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01668 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01668 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01668 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01668 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01668 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01668 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01668 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01668 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01668 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01668 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01668 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01668 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01668 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01668 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01668 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01668 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
P01668 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01668 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01668 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01668 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01668 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms