Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casp8O89110 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms