Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dnmt3bO88509 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms