Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccl22O88430 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccl22O88430 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccl22O88430 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccl22O88430 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccl22O88430 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccl22O88430 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl22O88430 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms