Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlkO54988 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlkO54988 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlkO54988 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms