Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LatO54957 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LatO54957 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LatO54957 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LatO54957 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LatO54957 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LatO54957 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LatO54957 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LatO54957 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LatO54957 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LatO54957 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LatO54957 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LatO54957 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LatO54957 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LatO54957 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LatO54957 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LatO54957 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LatO54957 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LatO54957 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LatO54957 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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LatO54957 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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LatO54957 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LatO54957 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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