Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms