Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkaO54804 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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