Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffaO54786 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffaO54786 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DffaO54786 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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