Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Tnfrsf18O35714 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf18O35714 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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