Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ppfibp2O35711 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms