Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2bO35690 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms