Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pold2O35654 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pold2O35654 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pold2O35654 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pold2O35654 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pold2O35654 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pold2O35654 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms