Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms