Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Clk2O35491 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Clk2O35491 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Clk2O35491 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Clk2O35491 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Clk2O35491 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Clk2O35491 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Clk2O35491 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Clk2O35491 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk2O35491 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clk2O35491 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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