Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms