Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms