Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcc1O35379 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms