Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ColqO35348 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ColqO35348 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms