Protein–RNA interactions for Protein: O35188

Cx3cl1, Fractalkine, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cx3cl1O35188 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cx3cl1O35188 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cx3cl1O35188 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cx3cl1O35188 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cx3cl1O35188 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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