Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ArxO35085 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ArxO35085 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ArxO35085 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms