Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casq1O09165 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms