Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EllO08856 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EllO08856 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EllO08856 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EllO08856 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EllO08856 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EllO08856 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EllO08856 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EllO08856 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EllO08856 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EllO08856 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EllO08856 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EllO08856 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EllO08856 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EllO08856 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EllO08856 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EllO08856 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EllO08856 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EllO08856 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EllO08856 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EllO08856 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EllO08856 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EllO08856 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EllO08856 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EllO08856 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EllO08856 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms