Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra2O08842 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms