Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MttpO08601 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MttpO08601 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MttpO08601 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MttpO08601 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MttpO08601 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MttpO08601 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MttpO08601 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MttpO08601 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms