Protein–RNA interactions for Protein: M0QWW3

Gm3187, Predicted gene 3187 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3187M0QWW3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3187M0QWW3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3187M0QWW3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3187M0QWW3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3187M0QWW3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3187M0QWW3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3187M0QWW3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3187M0QWW3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3187M0QWW3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3187M0QWW3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms