Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3248K7N721 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms