Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3099J3QPA5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3099J3QPA5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms