Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm5294J3QP53 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm5294J3QP53 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm5294J3QP53 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5294J3QP53 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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