Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm6594J3QM43 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm6594J3QM43 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6594J3QM43 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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