Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms